Джирайя мертв, убитый в результате заговора, а тринадцатилетний Наруто объявлен его убийцей. Скрываясь на горе Мьёбоку и следуя предсмертному наставлению учителя, Наруто наращивает свою мощь и рвется вернуться.
Вернувшись, ему предстоит выполнить множество целей, поиграть в кошки-мышки с Корнем, убить множество врагов... и не только врагов, и показать, на что способен действительно свободный человек