История начинается в мрачном Нью-Йорке, спустя 8 лет после катастрофы на Манхэттене. В этом мире мутанты загнаны в подполье, за ними охотятся безжалостные Стражи, а правительство ведет политику тотального контроля. Именно в такой момент в этот мир попадают Наруто и Саске — два молодых шиноби из другого измерения.
Что ждет их в мире, где сверхспособности считаются проклятием? Как изменит их встреча с Людьми Икс? И какие тайны хранит Саске о судьбе их родного мира?
В центре повествования — сложные взаимоотношения героев, их внутренние конфликты и борьба за выживание. Особое место занимает история Роуг — мутанта, чье прикосновение смертельно для окружающих. Но что произойдет, когда она встретит того, кто способен к ней прикоснуться?
