Нижний Цех празднует победу, но Дима не находит покоя. Анализируя ментальный след мертвого Архитектора, он понимает страшную истину: вирус был направлен в Заун не случайно. Архитектор — гениальный нейробиолог, инсценировавший свою смерть, — всё это время манипулировал элитами Пилтовера, играя на их страхах.
Чтобы разоблачить кукловода, герои должны пойти против системы. Собрав неопровержимые доказательства, стая врывается в Зал Совета Пилтовера. Теперь им предстоит не битва с монстрами, а война с правдой, способной разрушить оба города. Герои они или террористы — зависит от того, чью сторону примет Совет.