1946 год. Мир на пепле войны, но новые угрозы уже в тени. Трое — американец, британец, русский — создают тайную структуру, стоящую над национальными интересами. Так рождается «Атлас».
На развалинах Берлина, в охваченном восстанием Будапеште, в дни Карибского кризиса агенты «Атласа» ведут невидимую войну с «Пантеоном» — организацией, готовой разжечь пожар третьей мировой.
Но самое страшное открытие ждёт их в Антарктиде. Там они делают первый контакт с внеземной цивилизацией, наблюдавшей за Землёй тысячелетия. Знание, которое может спасти человечество — или уничтожить, если попадёт не в те руки.
«Атлас. Зарождение» — начало пути, который приведёт к программе «Наследие», к звёздам и битве за будущее, о которой никто не должен узнать.